長文になってしまったので端的に言うと、展示に満足・施設内の混雑対策に不満 という内容です。

＊良かった点：展示内容・シャトルバス運行
本当に圧巻でした。施設自体がとにかく広い・綺麗で、展示に添付された説明書きも分かりやすいのでじっくり読むのが楽しかったです。特別展では実物の展示も多く、信じられないような不思議な気持ちでした。
無料のシャトルバスの運行もありがたかったです。本当に大渋滞だったので、車でお越しの方は変に博物館まで来ずに道の駅に停めてバスを利用した方が絶対に楽です。ちなみに、バスは一般車通行止めの道を通ります。何分おきに来るなどの案内はなかったですが、道の駅であれば想像以上に頻繁に来ます。

＊あんまりだった点
お盆の繁忙期なのである程度は仕方ないと思いますが、バス以外の混雑緩和策が機能していない（そもそもしてない？）ようでした。良かった点に施設の広さをあげましたが、施設内はどこに行っても人人人！でした。
通常展示では順路もあるようなないような状態（音声ガイドの番号が振られているので、それの通りに行くのがいわゆる順路なのかなと思いますが案内は無し）のため、各々がかなり自由に動き回っていました。ベビーカーや車椅子を押す方々・手繋ぎで歩くお子様連れのご家族が身動きが取れなくなっているシーンを何度も見て、本当に大変そうだと感じました。
休憩として座れるスペースも沢山用意されていましたが、入場客が飽和しきって全く足りていませんでした。レストランがお土産屋さんの奥という謎立地のためお土産屋さんの入り口が大混雑で、そこでも子供が埋もれてしまっていて可哀想でした。ちなみに13:00頃に見に行くと2時間待ちだったので、レストランは諦めました。施設外のご飯屋さん？も席が足りず、料理の提供も全く追いついておらずここでも諦めました。

少しでも混雑具合が分かるような写真を添付しました。
展示内容は本当に満足いくもので 一緒に行った夫も満足気だったので、次回行くなら子供ができた時に通常の土日に行きたいです。